Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms