Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3252E9PUT9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms