Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms