Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm5483B2RV77 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5483B2RV77 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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