Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms