Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms