Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms