Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Samt1A2BED8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms