Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SktA2AQ25 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SktA2AQ25 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms