Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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