Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scn1aA2APX8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms