Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34dA2AGU5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34dA2AGU5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34dA2AGU5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34dA2AGU5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms