Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms