Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms