Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col9a3A2ACT7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col9a3A2ACT7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms