Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms