Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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