Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms