Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms