Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms