Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E5

Atoh7, Protein atonal homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh7Q9Z2E5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atoh7Q9Z2E5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms