Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms