Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms