Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip6Q9Z1Y4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms