Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cpne6Q9Z140 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne6Q9Z140 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms