Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms