Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cldn9Q9Z0S7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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