Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip2Q9Z0H8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms