Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms