Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms