Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms