Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms