Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms