Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms