Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Kcnip3Q9QXT8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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