Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc5Q9QX29 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms