Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdcQ9QW08 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms