Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms