Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Higd1aQ9JLR9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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