Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms