Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms