Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms