Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms