Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms