Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnft1Q9DCN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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