Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms