Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms