Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms