Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms