Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9D7E4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms